DELTA 426566 2213 22 SVNeT ]tq5.0ENDREP DELTA 370220 1061 171 SVN/1//TIMESTAMP = 1480648908 SHA256 (ncbi-blast-2.5.0+-src.tar.gz) = cce122a29d309127a478353856b351914232e78a9546941781ff0a4c18ec9c54 SIZE (ncbi-blast-2.5.0+-src.tar.gz) = 19938544 ENDREP DELTA SVNY[YY--- src/build-system/Makefile.in.top.orig 2014-11-13 01:41:55.000000000 +0900 +++ src/build-system/Makefile.in.top 2016-12-02 16:39:58.415910000 +0900 @@ -51,7 +51,7 @@ done cd $(includedir0) && find * -name CVS -prune -o -print |\ cpio -pd $(pincludedir) - $(INSTALL) -m 644 $(incdir)/* $(pincludedir) + cd $(incdir) && find * | cpio -pd $(pincludedir) ## set up appropriate build and status directories somewhere under $(libdir)? install-gbench: ENDREP DELTA 385376 0 524 SVN{i;'BBx^n Sp^D*Ec;P44TlTROCH11+[?YYbWf6Xηgy3g+]q4]Nŗ+(J%+/frIUŠX˷5˧oUe,_ƎB(l#x4# HReo2qbP>je1q: tc[h IRP]wWA1"Ԃ&C.H~[oVDkQPlIE1bYa1 E TBRv!YPY#~F&z ciHd 8e0O{$cv }x`a.$kRQ=W@Xf\F6XTa&Kbd9x^n0 {b7XavM%"(ۏJ]WgI/6e(sˤ=٭pL)h}u}!|uIcI“DS*H c8 dLJلYpj{=(+8]ԁg;q.7N2UfZUo蝖x^|;2s JU*BAkRm=B,r+M`b3Z``!RDlFmy,C8pfڲ$zjĝ~[U3eY:H#  S^jz%:}׷gk?S w^FX^F#31L {|8/ekO۽GrGNq[#{19fp<$sBץLr%$[ȃ\KVzT:%l|[1X ]tg8S)kC {iQQf jKRRmo{[Al^oxqהtq'!_ i{$Upd f|%vÍ~b dWP#cksZ#Ep<ΰr`^v̜>E2bʅ"Y? )Y͑p eɯ ~˨^&/o)rPXp¸@uy H}^[]lNS# {G:!֎4vÍc??濢GЎ/dKr 脔PKӼ^3bXB1, NAǕ7CP`rcg3e`t_Ұ<rNÔ q:߶!Bb5 $ssc˕C7"Ζ(t*#ڠl|Cc`} :ufEqfZA [96}("t*"FR+U|-ȉAՒJn4^(lAZǎtRڪ6Tãi(TzI?3 \E\\x^V .:g8TG@hmT* 4_.ua*:_!U(MpNgoibKEQ;1Z8ivjfPmW4ѭ0fW̎X0"$I~2/D8$wB;b4Jfm"_" 1XXa!G1A5zOs)r/(![_y!mg (*|O0c>DBG7ꊭ7Kn2UDZV 5o?GB'Z8 cyy2uJ%݄G^AK۷bxhEXk)5>!('kb\^K0녥6zRލN +S7Պ0as8Bi(0 x:}$e< L B2/ fr#P]z]g=8'boJQAʱWːp4Үi<:Hy~j\1іbwVWx7jGOX`ה `:e'$Kk83vxW} Q*kDL|7+_z&a^"$~.AޗfH)gW$6El*,噗"xhXB>YThy@nP")XFbr58ݢ,yqje%D&PJ_:Zk n] Dqy~/ăENDREP id: 5-370220.0-375848.r428903/3732 type: file pred: 5-370220.0-375848.r426566/117387 count: 13 text: 428903 0 24 1620 1b74911062b64f0a8e0feb809d3ab3e5 336e17098f0df17fa3ae7c39740829db8bb99974 428902-96xz/_4 props: 300914 71 103 0 bb58aa814bbdf5f7c1ab04a05656f5a5 cpath: /head/biology/ncbi-blast+/Makefile copyroot: 375848 /head/biology/ncbi-blast+ id: 8-370220.0-375848.r428903/4081 type: file pred: 8-370220.0.r370220/22730 count: 1 text: 428903 52 193 175 509c55155bb00200df8b4d40dba16654 92c0c2ee4bf441c7414c43b8fd3c6164b1fff4c5 428902-96xz/_5 props: 300936 2259 98 0 8dda59e103a981389badbb35c2ee62ce cpath: /head/biology/ncbi-blast+/distinfo copyroot: 375848 /head/biology/ncbi-blast+ id: 6-428903.0-375848.r428903/4423 type: file count: 0 text: 428903 274 490 473 40802a2de219dec2face7ab7aa44b5c7 24128d8937f198e41b017f08a804c89a49d92616 428902-96xz/_8 props: 300936 2259 98 0 8dda59e103a981389badbb35c2ee62ce cpath: /head/biology/ncbi-blast+/files/patch-src_build-system_Makefile.in.top copyroot: 375848 /head/biology/ncbi-blast+ id: 6-385376.0-375848.r428903/4771 type: file pred: 6-385376.0-375848.r421635/75894 count: 3 text: 428903 777 333 745 94287914916a74df4296c1594268d080 03a98e370b60cc27f9920c4a84913c6c25f106e4 428902-96xz/_9 props: 300936 2259 98 0 8dda59e103a981389badbb35c2ee62ce cpath: /head/biology/ncbi-blast+/files/patch-src_build-system_configure copyroot: 375848 /head/biology/ncbi-blast+ PLAIN K 38 patch-src_build-system_Makefile.in.top V 35 file 6-428903.0-375848.r428903/4423 K 32 patch-src_build-system_configure V 35 file 6-385376.0-375848.r428903/4771 END ENDREP id: 5-385376.0-375848.r428903/5332 type: dir pred: 5-385376.0-375848.r421635/76367 count: 3 text: 428903 5151 168 0 d4d56c7f4cf9d160acd22e987f36ea55 cpath: /head/biology/ncbi-blast+/files copyroot: 375848 /head/biology/ncbi-blast+ id: c-370220.0-375848.r428903/5564 type: file pred: c-370220.0.r370220/23285 count: 1 text: 428903 1136 2565 209500 5de306201a37e5a4d0848724a327aa98 4178cc70feeb6cb09ab021433f6151c5a97854ee 428902-96xz/_a props: 300936 2259 98 0 8dda59e103a981389badbb35c2ee62ce cpath: /head/biology/ncbi-blast+/pkg-plist copyroot: 375848 /head/biology/ncbi-blast+ PLAIN K 8 Makefile V 35 file 5-370220.0-375848.r428903/3732 K 8 distinfo V 35 file 8-370220.0-375848.r428903/4081 K 5 files V 34 dir 5-385376.0-375848.r428903/5332 K 9 pkg-descr V 29 file a-370220.0.r370220/23007 K 9 pkg-plist V 35 file c-370220.0-375848.r428903/5564 END ENDREP id: 4-370220.0-375848.r428903/6192 type: dir pred: 4-370220.0-375848.r426566/118008 count: 15 text: 428903 5913 266 0 e23e0012ddeac2b55a662e4322ac02bd cpath: /head/biology/ncbi-blast+ copyroot: 375848 /head/biology/ncbi-blast+ PLAIN K 8 Makefile V 25 file 3-9066.0.r428872/463 K 7 ariadne V 28 dir 4-111985.0.r418840/51789 K 7 artemis V 28 dir 4-51988.0.r424411/181671 K 5 avida V 25 dir 4-57919.0.r426378/628 K 5 babel V 25 dir 2-9147.0.r395828/1878 K 8 bcftools V 27 dir 4-388638.0.r415914/2371 K 8 bedtools V 26 dir 4-406676.0.r420587/610 K 8 biococoa V 29 dir 4-181036.0.r397315/116345 K 7 biojava V 25 dir 4-33667.0.r424800/663 K 4 blat V 27 dir 4-157190.0.r428834/1239 K 6 bowtie V 29 dir 4-410180.0.r426566/115860 K 7 bowtie2 V 27 dir 4-411698.0.r415148/1078 K 3 bwa V 26 dir 4-397851.0.r425878/675 K 6 cd-hit V 28 dir 4-397318.0.r427552/77403 K 8 cdbfasta V 28 dir 4-397850.0.r403506/50233 K 6 chemeq V 26 dir 5-153895.0.r428829/956 K 8 clustalw V 27 dir 2-30406.0.r415839/59059 K 6 consed V 29 dir 4-213590.0.r421387/169413 K 4 crux V 28 dir 4-235460.0.r428057/34428 K 7 diamond V 27 dir 4-414686.0.r428850/1078 K 6 emboss V 27 dir 4-31178.0.r418829/61873 K 5 fasta V 28 dir 4-38205.0.r424411/182405 K 6 fasta3 V 27 dir 4-38207.0.r415503/88636 K 9 fastdnaml V 28 dir 4-33727.0.r405891/192753 K 7 fastool V 28 dir 4-397849.0.r403506/50877 K 8 fasttree V 29 dir 4-397848.0.r426566/117203 K 13 fastx-toolkit V 29 dir 4-397847.0.r412344/719421 K 9 fluctuate V 25 dir 4-45885.0.r401907/565 K 6 garlic V 26 dir 4-85720.0.r371237/6475 K 6 gff2ps V 28 dir 4-51813.0.r412344/720078 K 4 gmap V 28 dir 4-174086.0.r425758/50186 K 9 gperiodic V 28 dir 2-21330.0.r428152/154803 K 6 grappa V 28 dir 4-44738.0.r415498/235859 K 5 hmmer V 27 dir 2-11871.0.r403506/53701 K 6 htslib V 28 dir 4-374729.0.r424427/99747 K 5 iolib V 27 dir 4-240487.0.r414372/1405 K 7 jalview V 29 dir 4-155905.0.r415498/236602 K 9 jellyfish V 27 dir 4-411785.0.r425879/7262 K 5 lagan V 28 dir 4-157464.0.r415503/89858 K 6 lamarc V 26 dir 4-45915.0.r428831/1297 K 13 libgtextutils V 29 dir 4-397846.0.r424427/101190 K 7 libsbml V 28 dir 4-234730.0.r425174/63007 K 19 linux-foldingathome V 29 dir 4-171590.0.r421387/170127 K 5 mafft V 29 dir 4-157209.0.r415498/237345 K 5 mapm3 V 29 dir 4-210625.0.r415498/238094 K 7 migrate V 26 dir 4-45878.0.r413499/2085 K 6 molden V 27 dir 2-18587.0.r428057/35107 K 5 mopac V 27 dir 2-18535.0.r428057/35790 K 7 mrbayes V 27 dir 4-203737.0.r364996/1442 K 6 mummer V 27 dir 4-203638.0.r393581/1453 K 6 muscle V 27 dir 4-213031.0.r425879/7950 K 11 ncbi-blast+ V 34 dir 4-370220.0-375848.r428903/6192 K 12 ncbi-toolkit V 27 dir 4-34402.0.r428135/12720 K 6 njplot V 33 dir 4-213034.0-426241.r427329/674 K 10 p5-AcePerl V 26 dir 4-31083.0.r425879/8681 K 22 p5-Bio-ASN1-EntrezGene V 26 dir 4-145476.0.r428869/944 K 10 p5-Bio-Das V 26 dir 4-141702.0.r428870/781 K 15 p5-Bio-Das-Lite V 29 dir 4-250445.0.r412344/726762 K 11 p5-Bio-GFF3 V 29 dir 4-273031.0.r412344/727480 K 12 p5-Bio-Glite V 29 dir 4-231492.0.r412344/728199 K 15 p5-Bio-Graphics V 27 dir 4-229849.0.r428874/1834 K 14 p5-Bio-MAGETAB V 29 dir 4-236853.0.r412344/729641 K 12 p5-Bio-NEXUS V 29 dir 4-240135.0.r415498/240218 K 12 p5-Bio-Phylo V 26 dir 4-162248.0.r428871/700 K 10 p5-Bio-SCF V 29 dir 4-240489.0.r412344/731789 K 10 p5-BioPerl V 33 dir 4-31084.0-428868.r428868/1204 K 14 p5-BioPerl-Run V 34 dir 4-161213.0-428872.r428872/1354 K 15 p5-transdecoder V 29 dir 4-411246.0.r412344/734001 K 4 paml V 27 dir 2-30407.0.r425174/64429 K 5 phrap V 27 dir 4-213596.0.r370983/3739 K 5 phred V 28 dir g-213596.0.r365765/23553 K 6 phylip V 28 dir 2-30408.0.r412344/734701 K 5 phyml V 29 dir 4-238140.0.r412344/735349 K 5 plink V 28 dir 4-304954.0.r428057/36475 K 8 plinkseq V 27 dir g-304954.0.r425879/9376 K 7 primer3 V 27 dir 4-66513.0.r354670/62518 K 8 protomol V 27 dir 4-161442.0.r428835/4404 K 5 psi88 V 27 dir 2-18534.0.r428057/37157 K 14 py-biom-format V 27 dir 4-414865.0.r422697/2772 K 12 py-biopython V 26 dir 4-31163.0.r422643/1455 K 8 pycogent V 27 dir 4-236469.0.r419818/1200 K 7 pyfasta V 29 dir 4-244412.0.r415498/243704 K 12 python-nexus V 27 dir 4-246859.0.r416534/1021 K 9 recombine V 27 dir 4-45886.0.r418767/75989 K 8 ruby-bio V 28 dir 4-49156.0.r412344/738801 K 8 samtools V 27 dir 4-374767.0.r415914/5415 K 7 seaview V 24 dir 2-9150.0.r416671/997 K 5 seqan V 27 dir 4-298619.0.r422156/2498 K 10 seqan-apps V 27 dir 4-414897.0.r427129/2176 K 6 seqan1 V 35 dir 4-298619.0-414898.r418767/76744 K 5 seqio V 25 dir 4-46640.0.r344538/970 K 8 seqtools V 27 dir 5-333374.0.r425863/2038 K 4 sim4 V 25 dir 4-31064.0.r344539/879 K 7 slclust V 28 dir 4-411697.0.r416469/51601 K 5 ssaha V 29 dir 4-215429.0.r426566/118749 K 11 tRNAscan-SE V 26 dir 4-56741.0.r415128/2758 K 8 t_coffee V 27 dir 4-53719.0.r428057/37839 K 6 tinker V 27 dir 2-14597.0.r428057/38572 K 10 treepuzzle V 28 dir 4-70552.0.r340722/506561 K 9 treeviewx V 28 dir 4-46356.0.r422140/122961 K 11 trimmomatic V 27 dir 4-411261.0.r411261/2756 K 5 ugene V 28 dir 4-312798.0.r425758/50915 K 8 vcftools V 27 dir 4-409624.0.r427136/3407 K 6 velvet V 26 dir 4-243919.0.r377443/787 K 4 wise V 28 dir 4-66053.0.r428152/155489 K 6 xmolwt V 28 dir 2-21329.0.r428152/156133 END ENDREP id: 1-9066.0.r428903/11399 type: dir pred: 1-9066.0.r428874/7004 count: 2066 text: 428903 6420 4966 0 7528733503855bbc04d07dd309573043 cpath: /head/biology copyroot: 0 / PLAIN K 10 .arcconfig V 26 file 1-354154.0.r422906/41 K 14 .gitattributes V 27 file 1-411777.0.r411777/210 K 10 .gitignore V 26 file 1-348322.0.r376072/79 K 7 CHANGES V 27 file 1-99373.0.r428889/3033 K 15 CONTRIBUTING.md V 27 file 1-348323.0.r348323/344 K 9 COPYRIGHT V 26 file 1-146787.0.r404934/49 K 4 GIDs V 28 file 1-168311.0.r428883/2657 K 8 Keywords V 27 dir 1-314142.0.r419368/1305 K 5 LEGAL V 24 file 1-748.0.r420195/336 K 5 MOVED V 26 file 1-69878.0.r428875/610 K 8 Makefile V 24 file 1-6.0.r424411/75633 K 2 Mk V 22 dir 1-5.0.r428895/2582 K 6 README V 25 file 1-2408.0.r340854/956 K 9 Templates V 24 dir 1-2932.0.r414724/906 K 5 Tools V 26 dir 3-15302.0.r421545/3096 K 4 UIDs V 28 file 4-168311.0.r428883/2940 K 8 UPDATING V 28 file 1-102685.0.r428879/1305 K 13 accessibility V 27 dir 1-42583.0.r428152/46784 K 6 arabic V 27 dir 1-38973.0.r425933/52485 K 9 archivers V 25 dir 1-242.0.r428887/13296 K 5 astro V 25 dir 1-301.0.r428889/13675 K 5 audio V 25 dir 1-148.0.r428895/47426 K 4 base V 26 dir 1-420954.0.r425903/598 K 10 benchmarks V 23 dir 1-62.0.r428828/5977 K 7 biology V 26 dir 1-9066.0.r428903/11399 K 3 cad V 25 dir 1-276.0.r428889/63505 K 7 chinese V 25 dir 1-3770.0.r428775/6783 K 5 comms V 24 dir 1-76.0.r428773/11797 K 10 converters V 26 dir 1-1561.0.r428494/93997 K 9 databases V 25 dir 1-771.0.r428897/56425 K 9 deskutils V 27 dir 1-2098.0.r428889/133732 K 5 devel V 25 dir 1-73.0.r428902/311340 K 3 dns V 26 dir 1-6145.0.r428883/17119 K 7 editors V 24 dir 4-6.0.r428889/463486 K 9 emulators V 26 dir 1-181.0.r428889/473532 K 7 finance V 26 dir 1-4110.0.r428736/11895 K 6 french V 26 dir 1-25673.0.r428229/2324 K 3 ftp V 24 dir 1-199.0.r428858/5854 K 5 games V 25 dir 1-104.0.r428843/58500 K 6 german V 25 dir 1-7451.0.r428750/2734 K 8 graphics V 25 dir 1-94.0.r428889/532900 K 6 hebrew V 28 dir 3-31142.0.r425933/458841 K 9 hungarian V 29 dir 1p-38973.0.r425933/460362 K 3 irc V 23 dir 1-42.0.r428833/7319 K 8 japanese V 26 dir 1-410.0.r428581/460157 K 4 java V 25 dir 1-2798.0.r428692/7811 K 6 korean V 27 dir 1-5873.0.r428152/898981 K 4 lang V 24 dir 1-15.0.r428800/18429 K 4 mail V 24 dir 1-57.0.r428797/58640 K 4 math V 25 dir 1-162.0.r428901/38736 K 4 misc V 25 dir 7-35.0.r428889/559033 K 10 multimedia V 25 dir d-333.0.r428896/36277 K 3 net V 24 dir 1-22.0.r428882/78776 K 6 net-im V 28 dir 15-11144.0.r428720/10846 K 8 net-mgmt V 26 dir r-1011.0.r428885/19819 K 7 net-p2p V 28 dir g-29106.0.r428581/557858 K 4 news V 24 dir 1-145.0.r428673/5360 K 4 palm V 28 dir 1-6646.0.r428152/1229608 K 6 polish V 27 dir tv-38973.0.r428751/2249 K 10 ports-mgmt V 25 dir 1-5132.0.r428587/4812 K 10 portuguese V 26 dir 1-17842.0.r426671/2214 K 5 print V 24 dir 1-79.0.r428731/15484 K 7 russian V 25 dir 1-1559.0.r428624/3731 K 7 science V 27 dir n-5356.0.r428889/597172 K 8 security V 26 dir 1-269.0.r428889/662509 K 6 shells V 22 dir w-6.0.r428847/4155 K 8 sysutils V 25 dir b-339.0.r428867/65456 K 8 textproc V 25 dir 1-322.0.r428844/94994 K 9 ukrainian V 29 dir g-39704.0.r428150/1199097 K 10 vietnamese V 25 dir 1-4812.0.r426675/2930 K 3 www V 26 dir 1-114.0.r428900/144492 K 3 x11 V 24 dir 1-16.0.r428840/26359 K 10 x11-clocks V 27 dir 1-931.0.r428152/1730396 K 11 x11-drivers V 27 dir 1-157567.0.r428258/4810 K 6 x11-fm V 27 dir 1-691.0.r428152/1736263 K 9 x11-fonts V 25 dir 1-543.0.r428529/11051 K 11 x11-servers V 25 dir 1n-710.0.r427347/1612 K 10 x11-themes V 29 dir 1-14410.0.r428152/1771168 K 12 x11-toolkits V 26 dir 1-120.0.r428889/679416 K 6 x11-wm V 23 dir 1-40.0.r428818/7739 END ENDREP id: 2-1.0.r428903/15095 type: dir pred: 2-1.0.r428902/315035 count: 425086 text: 428903 11570 3512 0 59adf79915c743448ed6ece9a02b7484 props: 7322 2587 45 0 7a04b33bf8e35fd5c3d111baaf403dc5 cpath: /head copyroot: 0 / PLAIN K 8 branches V 23 dir 0-1.0.r428796/51138 K 4 head V 23 dir 2-1.0.r428903/15095 K 8 projects V 30 dir 0-377393.0.r378744/3577692 K 8 svnadmin V 22 dir 3-1.0.r428591/1329 K 4 tags V 22 dir 8-1.0.r421958/5118 END ENDREP id: 0.0.r428903/15536 type: dir pred: 0.0.r428902/315478 count: 428903 text: 428903 15312 211 0 17c8bea7ff1f27975034a1f81e0ab01c props: 341041 7130 346 0 8b695b9f61597e4917effffba3bbfaa3 cpath: / copyroot: 0 / minfo-cnt: 35 5-370220.0-375848.t428902-96xz modify-file true false /head/biology/ncbi-blast+/Makefile 8-370220.0-375848.t428902-96xz modify-file true false /head/biology/ncbi-blast+/distinfo _6.0-375848.t428902-96xz add-file true true /head/biology/ncbi-blast+/files/patch-src_build-system_Makefile.in.top 6-385376.0-375848.t428902-96xz modify-file true false /head/biology/ncbi-blast+/files/patch-src_build-system_configure c-370220.0-375848.t428902-96xz modify-file true false /head/biology/ncbi-blast+/pkg-plist 15536 15761